Brooklyn Evolution Melonfrost стартапы микробтарды көбейту үшін 7 миллион доллар жинады

Сэм Левиннің атасы Батыс Массачусетс штатындағы бесінші ұрпақ картоп фермері болды, ол Орта Батыстағы өнеркәсіптік фермалардан картоп бағасының төмендеуімен күресу үшін күресті. Бірқатар басқа да дақылдарды өсіруге тырысқаннан кейін, Пуэрто-Рикодан контрабандалық жолмен әкелінген қауын тұқымдарының жиынтығы аймақтың құмды сазды топырағында гүлденген сияқты. Бұл қауындар егін жинауға пісіп-жетілді, аяз басылып, егінді өлтіргенше - осылайша отбасылық аңыз бар.

Левин қазір Бруклинде орналасқан Melonfrost эволюциялық стартапының бас директоры және тең құрылтайшысы болып табылады, ол эволюцияны автоматтандырылған жабық циклде басқару үшін өзінің жеке бағдарламалық жасақтамасы мен аппараттық құралдарын біріктіреді. Технология азық-түлік пен энергиядан бастап терапиялық және синтетикалық материалдарға дейінгі барлық ауқымда жаңа микробтарды жобалау және өндірудің жаңа әдісін қамтамасыз етуге бағытталған - мұның бәрі инженерияның немесе болашақты құрудың емес, керісінше, өсіп келе жатқан ол. «Біз үшін бұл аяз сияқты апаттарға бұдан былай толықтай көнбеу, аязға төзімді қауындарды кез келген қажетті пайдалану үшін метафоралық түрде жасай алу», - деп түсіндіреді ол.

Қажетті пайдалану үшін белгілі бір белгілері бар микробтарды өсіруге арналған әртүрлі құралдар тарихи түрде масштабтау мүмкіндігімен шектелген - өңделген штаммнан коммерцияланғанға өтуге кедергі жасайды - мұны істеудің көптеген әдістері салыстырмалы түрде қымбат және біршама дөрекі күш болжамына сүйенеді. -және-тексеру әдістері әдетте генетикалық тізбектегі мутацияларға негізделген. Оның орнына, Refactor Capital және Alexandria Venture Investments бірлесіп басқаратын Melonfrost компаниясының жақында 7 миллион долларлық тұқым раунды Левин айтқандай, «эволюция ұзақ уақыт бойы организмдердің ең жақсы дизайнері болып табылады және әлі де болады» деген тезисті қолдайды.

Фенотипті таңдауға назар аударудың негізінде Melonfrost's Evolution Reactor аппараттық құралы және Maia, оның меншікті бағдарламалық платформасы бар. Maia - өлшенген фенотиптерге қатысты әртүрлі іріктеу қысымдары мен қоршаған орта жағдайларына қатысты организмдердің эволюциясын үйренетін және қажетті нәтиженің дамуын жалғастыру үшін әрі қарай таңдау қысымдары түріндегі нұсқаулар жинағын итеративті түрде қайтаратын машиналық оқыту алгоритмдерінің жиынтығы. шығымдылық немесе аязға төзімділік белгілерінің жиынтығы. Бұл кіріс және шығыс деректері Майяны эволюциялық реакторға, параллель эволюциялық траекторияларда мыңдаған тәуелсіз микробтық популяцияларды өсіру үшін осы кодталған таңдау қысымдарын жеке бақылауға, өлшеуге және қолдануға арналған құрылғыға қосады.

Масштаб бойынша эволюцияны басқару Эволюция реакторындағы модульдік блоктар жиымында инкапсуляцияланған бірқатар аппараттық инновациялардың арқасында мүмкін болды, олардың әрқайсысында шамамен 250 жеке микроб популяциясы бар. Виртуалды және механикалық екі платформа автоматтандырылған эволюцияны басқару платформасының циклін жабатын бұлттық бағдарламалық құрал арқылы біріктірілген - бағдарламалық құралға берілген аппараттық құрал арқылы өлшенетін деректер, модельдеу бағдарламалық құралының жаңартулары арқылы аппараттық құралға қайтарылатын нұсқаулар - қажетті фенотипке дейін қайталанады. мақсатқа қол жеткізілді немесе цикл жабылады. Қазіргі уақытта бүкіл жүйе Melonfrost-тың Бруклиндегі зертханалық кеңістігіне сәйкес келеді, бірақ Левин бұл аппараттық-бағдарламалық интерфейстің көрінісін Evolution Reactor қоймасы түріндегі «биологиялық деректер орталығы» ретінде көрсетеді.

Бұл тұқым айналымы осы эволюциялық басқару жүйесінің толық формасына қарай келесі қадам болып табылады - Evolution Reactor жабдығын құрудың келесі кезеңін қаржыландыру және Melonfrost-ты азық-түлік секторының жеуге жарамды майлар кеңістігіндегі алғашқы тұтынушысына жылжыту. Левин: «Әлемді процесс барысында оны жоймай тамақтандыру - бұл синтетикалық биологияның саласы, атап айтқанда, бастапқы құрастырудан өндіріске дейін көптеген кедергілер бар», - деп атап көрсетеді. Азық-түлік арқылы сау әлемді құруға бағытталған бұл назар Левин мен оның негізін қалаушы, инженерия және дизайн бөлімінің басшысы және балалық шақтағы досы Лорен Амдал-Куллетон үшін жаңалық емес. Орта мектепте бұл дуэт студенттердің оқу қоғамдастығына инвестициясын арттыру және тұрақтылыққа ұмтылу үшін асханасы үшін ферма ашты. Бакалавриат пен магистратурада оқу жылдарын мұхитпен және тұтас бір елмен бөлінгеніне қарамастан, екеуі Оксфордтан Стэнфордқа дейін байланыста болды, өйткені олар сәйкесінше эволюциялық динамика мен күшейтілген оқытуды зерттеді және эволюциялық модельдердегі олқылықтарды машинамен толтыру әлеуетін байқай бастады. олардың негізгі математикалық ұқсастықтары берілген оқу құралдары. Балалық шақтағы басқа екі досымен бірге Melonfrost дүниеге келді - бұл әртүрлі салаларда синтездеу арқылы оң әсер ету арқылы, ең озық машиналық оқыту мен аппараттық инженериядан синтетикалық биологияға және нақты таңдамалы бағдарламалық құралдарға дейін.

«Осы әрекеттердің кез келгені үлкен тәжірибені, сәтсіздікті және жаңашылдықты қажет етеді, сондықтан олардың барлығын бір уақытта жасау әдеттен тыс нәрсе, - деп мойындайды Левин, - бірақ бұл қиындықтар соншалықты үлкен, сондықтан сізге жаңашылдық енгізу керек. бір уақытта бірнеше майданда және болашақты шынымен өсіру үшін әр түрлі ғалымдар мен инженерлерді біріктіреді. Бұл нарыққа жаңа молекулаларды немесе химиялық заттарды шығаруды мақсат ету ғана емес; керісінше, біз әлемдік ресурстардың пайда болу және қозғалу тәсілін түбегейлі өзгертуіміз керек». Melonfrost үшін мақсат ақыр аяғында үлкен зауыттар салып, жүк контейнерлерінде жөнелту емес. Оның орнына, көзқарас жаңа штаммдарды тез, арзан және сенімді түрде жасау және оңтайландыру - метафоралық аяздың қашан келуіне қарамастан, эволюция тілін үйренуден ауқымды сенімді биологиялық нәтижелерге аудару үшін жалпы өндіріске кеңейту.

Осы мақала бойынша қосымша зерттеулер мен есеп беру үшін Айшани Аатрешке рахмет. Мен SynBioBeta негізін салушымын және мен жазатын кейбір компаниялар демеуші болып табылады SynBioBeta конференциясы және апта сайынғы қорыту.